انجمن های علمی حوزه با ۵ هزار عضو وابسته و پیوسته در این دبیرخانه مشغول به فعالیت هستند؛ انجمن های علمی حوزه در حوزه ماموریت هایی که دارند به فعالیت می پردازند؛ ۵کار عمده در این انجمن ها انجام می شود که اول مباحثات عالی علوم بین اساتید است.