شورای عالی حوزه‌های علمیه، آیت الله حسینی بوشهری را به عنوان دبیر شورای عالی، آیت الله مروی را به عنوان دبیر دوم این شورا و آیت الله اعرافی را به عنوان مدیرحوزه‌های علمیه انتخاب کرد.